Школа № 559 Выборгского района Санкт-Петербурга была открыта в 1988 году.
Школа является районной экспериментальной площадкой по теме «Проектная и исследовательская деятельность учащихся как инструмент формирования универсальных учебных действий» и городской школой – лабораторией по теме «Разработка инструментария использования инновационных технологий обучения для учащихся начальных классов на основе УМК «Перспектива».
В школе имеется 3 кабинета информатики, оборудованные кабинеты физики, химии и ОБЖ. В 2013 году сделан ремонт спортивного зала. Все кабинеты оснащены компьютерами, объединенными в единую локальную сеть.