Основным направлением деятельности ФКУ «ГБ МСЭ по Санкт-Петербургу» является проведение экспертной диагностики людей с целью определения их реабилитационного потенциала, ограничений жизнедеятельности и потребности в мерах социальной защиты.
На службу МСЭ возложено определение группы инвалидности, её причин, сроков, времени наступления инвалидности; потребности инвалида в различных видах социальной защиты; разработка индивидуальной программы реабилитации (ИПР) инвалида, разработка комплексных программ профилактики инвалидности; определение степени утраты профессиональной трудоспособности лиц, получивших трудовое увечье или профессиональное заболевание, определение причин смерти инвалида и другое.