Детский сад № 409 Кировского района Санкт-Петербурга был открыт в 1961 году.
С 1997 года работает как оздоровительное учреждение для детей с туберкулезной интоксикацией, а с 2006 года реорганизовано в ГДОУ детский сад № 409 компенсирующего вида для детей с туберкулезной интоксикацией. В 2010 году переименовано в ГДОУ детский сад № 409 присмотра и оздоровления Кировского района Санкт-Петербурга. В 2011 году переименовано в ГБДОУ детский сад № 409 Кировского района Санкт-Петербурга.