Высшая школа экономики была создана Постановлением Правительства России 27 ноября 1992 года первоначально как центр подготовки магистров. Принцип Школы с первого дня ее существования - сочетание строгой, даже жесткой, подготовки с обсуждением и решением животрепещущих проблем российской экономики.
Петербургский кампус НИУ "Высшая Школа Экономики" готовит бакалавров международного уровня по следующим направлениям: юриспруденция; экономика; менеджмент; политология, история и социология. В 2013 году планируется прием студентов на девять магистерских программ. Профессиональная переподготовка в очно-заочной и заочной форме ведется по программам основных направлений подготовки.
В рамках Высшей школы экономики успешно функционируют две международные научные лаборатории: Лаборатория cравнительных социальных исследований под руководством Рональда Инглхарта (США, Мичиганский университет) и Лаборатория теории рынков и пространственной экономики под руководством Жака-Франсуа Тисса (Католический университет Лувена), шесть лабораторий, два научных центра и восемь научно-учебных групп, интенсивная научная жизнь позволяет петербургскому кампусу сохранять высокую привлекательность как для студентов, так и для ведущих научных кадров Санкт-Петербурга.
Высшая Школа Экономики активно использует современные образовательные технологии. На всех факультетах введена модульная система обучения. При этой системе акцент делается на интенсивную самостоятельную работу студента, контролируемую преподавателями. В процессе учебы студент выполняет большое количество самостоятельных письменных заданий и работ, что позволяет вести текущий рейтинг студента. Учебный год разбивается не на два семестра, а на четыре модуля.
К сегодняшнему дню четко сформировались и устоялись принципы Высшей Школы: опора на требования мировой экономической и социальной науки; междисциплинарное взаимодействие (экономисты получают юридическое образование, и наоборот); непосредственная связь преподавания с практикой реформ, с результатами прикладных исследований; просветительская миссия в образовательном сообществе России, в ее регионах.
Постановлением Правительства РФ от 23 декабря 2010 года № 1109 «О создании федерального государственного автономного образовательного учреждения высшего профессионального образования «Национальный исследовательский университет «Высшая школа экономики» университет получил новое название и статус автономного образовательного учреждения.