Санкт-Петербургское государственное бюджетное нетиповое образовательное учреждение «Санкт-Петербургский музыкальный лицей» было создано в декабре 1995 г. на базе музыкальной школы № 12 Центрального района Санкт-Петербурга.
Основной задачей Лицея является выявление наиболее музыкально одаренных детей, их профессионально ориентированное обучение на начальном и среднем этапах образования, а также подготовка к продолжению обучения в музыкальных колледжах или вузах. Обучение детей основам музыкальной грамоты, музыкальной культуры и их творческое развитие начинается с трех лет на дошкольном отделении. В возрасте пяти лет дети начинают играть на различных музыкальных инструментах, с учетом их индивидуальных способностей.
После четвертого класса наиболее одаренные и профессионально ориентированные в области музыки и искусства ученики могут продолжить обучение по программам средней общеобразовательной школы и специальной подготовкой по музыкальным предметам.
Учебные планы лицея с 5 по 11 класс по общеобразовательным предметам имеют гуманитарную направленность и соответствуют ФГОС общего образования.
Практически все выпускники лицея продолжают свое профессиональное образование в музыкальных колледжах, консерваториях, академиях и институтах культуры разных городов России и мира. Многие учащиеся имеют звания лауреатов всероссийских и международных конкурсов