Лицей № 554 Приморского района Санкт-Петербурга был открыт в 1988 году как общеобразовательная школа.
В 1994 году школа получила статус школы с углубленным изучением химии и биологии, в 1996 году - акмеологической школы.
С 2000 года школа стала лицеем.
В Лицее реализуется два направления обучения: естественно-научное (химико-биологические классы с углубленным изучение химии и биологии) и техническое (информационно-технические классы с углубленным изучением математики и физики).
С 2012 года открыто структурное подразделение "Отделение дополнительного образования детей" (ОДОД).
Лицей на протяжении многих лет сотрудничает с Педиатрической академией, Медицинским институтом, медицинским училищем № 6.
С 2003 года Лицей сотрудничает с Факультетом технической кибернетики Санкт-Петербургского Политехнического университета.